تغير نظام القضاء في مصر الفرعونية قبل تحول الأقاليم إلى امارات عنه بعد هذا التحول فبينما كان الملك يجمع كل السلطات قبل تحول الأقاليم إلى امارات فإنه بعد تحول الأقاليم إلى امارات استقل الأمراء بأقاليمهم وكانت الأحكام تصدر باسم آلهتهم المحلية بدلاً من اسم الملك.
لم تعرف مصر في العصر الفرعوني نظام استقلال القضاء عن السلطة التنفيذية فكثير مت الحكام كانوا يتمتعون باختصاصات قضائية إلى جانب سلطاتهم الإدارية فالملك وهو الرئيس الأعلى للسلطة التنفيذية كان في نفس الوقت المرجع الأخير للقضاء رغم عدم مباشرته بنفسه نظر الدعاوي والفصل فيها.
محكمة خاصة للقضايا المهمة
كان يأمر في بعض الأحيان بتشكيل محكمة خاصة لنظر القضايا الذات أهمية بالغة وفي أحيان أخرة كانت المحكمة تكتفي بالتثبيت من إدانة المتهمين ثم ترفع الأمر إلى الملك التي يقرر العقوبو المناسبة كما كان للوزير أيضاً اختصاص قضائي إلى جانب اختصاصاته التنفيذية والإدارية فهو الذي كان يرأس محكمة الاستئناف العليا في العاصمة واختصاصتها كان يشمل القطر المصري كله، كما كان لرجال السلطة التنفيذية في الأقاليم تولى السلطة القضائية وكانوا يصدرون أحكامهم باسم الملك.
